Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Eb1P04230 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms