Protein–RNA interactions for Protein: Q9R061

Nubp2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nubp2Q9R061 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms