Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC12.15□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp29Q9ES63 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms