Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fundc1Q9DB70 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms