Protein–RNA interactions for Protein: Q9D658

Ptp4a3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a3Q9D658 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Ptp4a3Q9D658 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Ptp4a3Q9D658 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ptp4a3Q9D658 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Ptp4a3Q9D658 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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Ptp4a3Q9D658 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Phc1-203ENSMUST00000112600 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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Ptp4a3Q9D658 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms