Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

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Length 731 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Pdgfra-202ENSMUST00000168162 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smurf1Q9CUN6 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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