Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Use1Q9CQ56 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Use1Q9CQ56 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Use1Q9CQ56 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Use1Q9CQ56 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Use1Q9CQ56 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Use1Q9CQ56 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Use1Q9CQ56 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Use1Q9CQ56 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Use1Q9CQ56 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Use1Q9CQ56 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Use1Q9CQ56 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Use1Q9CQ56 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Use1Q9CQ56 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Use1Q9CQ56 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Use1Q9CQ56 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Use1Q9CQ56 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Use1Q9CQ56 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Use1Q9CQ56 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Use1Q9CQ56 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Use1Q9CQ56 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Use1Q9CQ56 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Use1Q9CQ56 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Use1Q9CQ56 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Use1Q9CQ56 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Use1Q9CQ56 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
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Use1Q9CQ56 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
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Use1Q9CQ56 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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