Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkn3Q8K045 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms