Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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FarsaQ8C0C7 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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FarsaQ8C0C7 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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FarsaQ8C0C7 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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FarsaQ8C0C7 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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