Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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