Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx1P80205 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx1P80205 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx1P80205 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx1P80205 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx1P80205 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx1P80205 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx1P80205 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx1P80205 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx1P80205 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms