Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SbdsP70122 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SbdsP70122 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SbdsP70122 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SbdsP70122 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SbdsP70122 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SbdsP70122 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SbdsP70122 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SbdsP70122 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SbdsP70122 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SbdsP70122 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms