Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Vbp1P61759 Ttc16-206ENSMUST00000161430 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Gm40634-201ENSMUST00000214129 2001 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Fut10-201ENSMUST00000066173 3183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Vbp1P61759 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Vbp1P61759 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Exoc7-203ENSMUST00000106413 3298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 P3h1-202ENSMUST00000081606 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Vbp1P61759 4930417O13Rik-203ENSMUST00000204911 3458 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Vbp1P61759 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Vbp1P61759 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Vbp1P61759 Top1-201ENSMUST00000109468 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Vbp1P61759 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Vbp1P61759 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Vbp1P61759 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Vbp1P61759 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Zfp512-201ENSMUST00000076264 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Zfp658-201ENSMUST00000005597 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 St5-203ENSMUST00000084738 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Bcl2l11-205ENSMUST00000110341 5036 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Fbxl5-202ENSMUST00000087465 4237 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Slc7a3-202ENSMUST00000101362 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Itgad-202ENSMUST00000106237 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Cux1-207ENSMUST00000176216 2821 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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