Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Gm11685-201ENSMUST00000141559 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Gm12532-201ENSMUST00000148448 2684 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Irf5P56477 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Irf5P56477 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irf5P56477 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Irf5P56477 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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Irf5P56477 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Gm15940-201ENSMUST00000156011 817 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irf5P56477 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Irf5P56477 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Gm45151-201ENSMUST00000205445 712 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Olfr684-201ENSMUST00000060893 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irf5P56477 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Irf5P56477 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irf5P56477 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Irf5P56477 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Gm22709-201ENSMUST00000116893 111 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irf5P56477 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Gm28064-201ENSMUST00000185639 858 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Gm19585-201ENSMUST00000186007 587 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Irf5P56477 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irf5P56477 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Irf5P56477 AC158388.1-201ENSMUST00000225441 256 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irf5P56477 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms