Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CartptP56388 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CartptP56388 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CartptP56388 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CartptP56388 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CartptP56388 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CartptP56388 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
CartptP56388 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CartptP56388 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CartptP56388 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CartptP56388 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
CartptP56388 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CartptP56388 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CartptP56388 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CartptP56388 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CartptP56388 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CartptP56388 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CartptP56388 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CartptP56388 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CartptP56388 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
CartptP56388 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
CartptP56388 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CartptP56388 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CartptP56388 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CartptP56388 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CartptP56388 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CartptP56388 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
CartptP56388 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
CartptP56388 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CartptP56388 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CartptP56388 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CartptP56388 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CartptP56388 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CartptP56388 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
CartptP56388 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
CartptP56388 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
CartptP56388 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
CartptP56388 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CartptP56388 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CartptP56388 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CartptP56388 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CartptP56388 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CartptP56388 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CartptP56388 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CartptP56388 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CartptP56388 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CartptP56388 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
CartptP56388 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CartptP56388 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CartptP56388 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CartptP56388 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CartptP56388 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CartptP56388 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
CartptP56388 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CartptP56388 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CartptP56388 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CartptP56388 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
CartptP56388 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CartptP56388 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CartptP56388 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
CartptP56388 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CartptP56388 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CartptP56388 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CartptP56388 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
CartptP56388 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CartptP56388 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CartptP56388 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CartptP56388 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
CartptP56388 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CartptP56388 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CartptP56388 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
CartptP56388 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CartptP56388 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
CartptP56388 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CartptP56388 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CartptP56388 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CartptP56388 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
CartptP56388 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CartptP56388 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CartptP56388 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CartptP56388 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CartptP56388 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CartptP56388 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CartptP56388 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CartptP56388 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CartptP56388 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CartptP56388 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CartptP56388 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CartptP56388 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CartptP56388 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CartptP56388 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CartptP56388 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CartptP56388 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CartptP56388 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CartptP56388 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
CartptP56388 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
CartptP56388 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
CartptP56388 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
CartptP56388 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
CartptP56388 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms