Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Aqp4P55088 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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