Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ClgnP52194 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ClgnP52194 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ClgnP52194 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ClgnP52194 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ClgnP52194 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ClgnP52194 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ClgnP52194 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Tiam2-202ENSMUST00000169838 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ClgnP52194 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms