Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtpreP49446 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Gm3099-202ENSMUST00000178274 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Ms4a5-202ENSMUST00000186937 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Gm37502-201ENSMUST00000192981 356 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Gm37469-201ENSMUST00000193728 890 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Gm6681-201ENSMUST00000205215 607 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Gm45525-201ENSMUST00000210800 389 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtpreP49446 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Elobl-201ENSMUST00000061938 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Olfr995-201ENSMUST00000099924 1113 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtpreP49446 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtpreP49446 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Cd3e-201ENSMUST00000102832 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Mir669o-201ENSMUST00000103898 96 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Ppp1r2-ps9-202ENSMUST00000173852 882 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Il6-204ENSMUST00000199765 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 AC132104.1-201ENSMUST00000213615 260 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Gm36287-201ENSMUST00000223481 796 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 CT030194.1-201ENSMUST00000225507 532 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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