Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Apoc1P34928 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Apoc1P34928 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Apoc1P34928 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Apoc1P34928 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Apoc1P34928 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms