Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TP20293 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TP20293 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TP20293 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TP20293 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TP20293 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TP20293 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TP20293 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TP20293 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TP20293 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TP20293 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TP20293 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TP20293 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TP20293 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TP20293 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TP20293 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TP20293 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TP20293 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TP20293 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TP20293 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TP20293 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TP20293 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TP20293 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TP20293 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TP20293 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TP20293 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TP20293 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TP20293 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TP20293 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TP20293 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TP20293 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TP20293 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TP20293 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TP20293 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TP20293 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TP20293 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TP20293 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TP20293 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TP20293 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TP20293 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TP20293 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TP20293 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TP20293 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TP20293 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TP20293 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TP20293 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TP20293 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TP20293 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TP20293 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TP20293 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TP20293 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TP20293 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TP20293 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TP20293 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TP20293 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TP20293 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TP20293 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TP20293 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TP20293 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
TP20293 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TP20293 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
TP20293 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TP20293 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
TP20293 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TP20293 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TP20293 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TP20293 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TP20293 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TP20293 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TP20293 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TP20293 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TP20293 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TP20293 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TP20293 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TP20293 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TP20293 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TP20293 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TP20293 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TP20293 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TP20293 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TP20293 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TP20293 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TP20293 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TP20293 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TP20293 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TP20293 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TP20293 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TP20293 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TP20293 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TP20293 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TP20293 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TP20293 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TP20293 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TP20293 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TP20293 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TP20293 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TP20293 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TP20293 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TP20293 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TP20293 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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