Protein–RNA interactions for Protein: P01676

Ig kappa chain V-VI region XRPC 24, mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01676 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01676 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P01676 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01676 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01676 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01676 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01676 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01676 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01676 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01676 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01676 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01676 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01676 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01676 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01676 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01676 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01676 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01676 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P01676 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01676 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01676 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01676 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01676 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01676 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01676 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01676 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01676 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01676 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01676 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01676 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01676 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01676 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01676 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01676 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01676 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01676 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01676 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01676 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01676 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01676 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P01676 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P01676 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01676 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01676 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01676 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01676 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P01676 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P01676 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01676 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01676 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P01676 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01676 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01676 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P01676 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01676 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01676 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01676 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01676 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01676 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01676 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01676 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01676 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01676 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01676 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01676 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01676 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01676 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01676 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01676 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01676 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01676 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01676 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01676 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P01676 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P01676 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P01676 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P01676 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P01676 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P01676 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P01676 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
P01676 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P01676 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P01676 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P01676 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
P01676 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P01676 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
P01676 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P01676 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
P01676 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
P01676 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P01676 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P01676 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
P01676 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P01676 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P01676 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
P01676 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
P01676 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P01676 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P01676 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P01676 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms