Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 4930533K18Rik-203ENSMUST00000219192 1307 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 AC100590.1-201ENSMUST00000220318 1357 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Sgsh-202ENSMUST00000100172 4223 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Csn1s1-201ENSMUST00000094641 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 H2-DMb2-202ENSMUST00000171231 1483 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Akap1-203ENSMUST00000107904 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Ascc2-201ENSMUST00000070257 2650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Iqgap3-204ENSMUST00000194440 3263 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 E330034G19Rik-203ENSMUST00000161740 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Zfand6-202ENSMUST00000178385 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 AC162301.1-201ENSMUST00000228785 1542 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Gm16575-201ENSMUST00000162186 1615 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Gm37356-201ENSMUST00000193362 1613 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Gm45737-201ENSMUST00000208344 1612 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Galntl5-201ENSMUST00000030778 1627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Ablim1-206ENSMUST00000111528 2481 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Irf2-201ENSMUST00000034041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Tdrd3-205ENSMUST00000170865 2530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Plekha8-201ENSMUST00000101385 1838 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 9430053O09Rik-201ENSMUST00000192654 2570 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Eml1-202ENSMUST00000109857 2627 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Samsn1-201ENSMUST00000114239 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Trim38-203ENSMUST00000226039 1999 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Olfr43-202ENSMUST00000205664 2018 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Gja6-201ENSMUST00000069417 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Cxcl9-201ENSMUST00000113093 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Gm11042-201ENSMUST00000110441 120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Mrps18c-202ENSMUST00000112898 460 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Gm8682-201ENSMUST00000121310 498 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Gm15488-201ENSMUST00000121682 670 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Gm21887J3QQ04 Gm11382-201ENSMUST00000140484 179 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms