Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3298E9PW80 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm3298E9PW80 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms