Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms