Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Psma1Q9R1P4 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Psma1Q9R1P4 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Psma1Q9R1P4 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Psma1Q9R1P4 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Psma1Q9R1P4 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Psma1Q9R1P4 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Psma1Q9R1P4 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Psma1Q9R1P4 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Psma1Q9R1P4 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Psma1Q9R1P4 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Psma1Q9R1P4 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Psma1Q9R1P4 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Psma1Q9R1P4 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Psma1Q9R1P4 Cdkl5-205ENSMUST00000198931 9796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Psma1Q9R1P4 Son-201ENSMUST00000114036 7945 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Psma1Q9R1P4 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Gm7967-202ENSMUST00000191042 5042 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Ano1-202ENSMUST00000118556 4566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Zfat-204ENSMUST00000162054 4386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Ank3-242ENSMUST00000183261 4999 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Gm44062-201ENSMUST00000203312 4857 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Shroom2-202ENSMUST00000101141 7494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Cspg4-201ENSMUST00000035661 8121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Nfrkb-201ENSMUST00000086167 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Heatr6-201ENSMUST00000001002 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Ehmt1-202ENSMUST00000091348 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Polr3b-201ENSMUST00000077175 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Psma1Q9R1P4 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms