Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gpc1Q9QZF2 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Gpc1Q9QZF2 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gpc1Q9QZF2 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gpc1Q9QZF2 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Gpc1Q9QZF2 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Gpc1Q9QZF2 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Gpc1Q9QZF2 Rd3l-201ENSMUST00000170525 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Gpc1Q9QZF2 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Gpc1Q9QZF2 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gpc1Q9QZF2 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Gpc1Q9QZF2 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gpc1Q9QZF2 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gpc1Q9QZF2 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gpc1Q9QZF2 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gpc1Q9QZF2 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Gpc1Q9QZF2 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
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Gpc1Q9QZF2 2310081O03Rik-201ENSMUST00000128591 759 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gpc1Q9QZF2 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gpc1Q9QZF2 Prl8a6-201ENSMUST00000018392 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gpc1Q9QZF2 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gpc1Q9QZF2 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gpc1Q9QZF2 Gm45078-201ENSMUST00000205343 546 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gpc1Q9QZF2 Gm45604-201ENSMUST00000209665 550 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gpc1Q9QZF2 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gpc1Q9QZF2 AC123043.1-201ENSMUST00000221068 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gpc1Q9QZF2 Gm6563-201ENSMUST00000056396 869 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gpc1Q9QZF2 Prl8a6-202ENSMUST00000080762 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gpc1Q9QZF2 Cldn34b3-201ENSMUST00000096389 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gpc1Q9QZF2 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gpc1Q9QZF2 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gpc1Q9QZF2 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gpc1Q9QZF2 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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