Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Casc1-208ENSMUST00000204105 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Gm44271-201ENSMUST00000204525 2600 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ChmQ9QXG2 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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