Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 4930444A19Rik-202ENSMUST00000190007 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm31466-201ENSMUST00000195457 916 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm29328-212ENSMUST00000209182 1168 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm45308-201ENSMUST00000210610 415 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 AC241616.1-201ENSMUST00000213741 166 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm34667-201ENSMUST00000222974 1258 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 2010109A12Rik-201ENSMUST00000031330 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Pebp1-201ENSMUST00000036951 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Cxcl10-201ENSMUST00000038816 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Fam186a-201ENSMUST00000062631 759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Olfr47-201ENSMUST00000078057 1059 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm22341-201ENSMUST00000083775 129 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Pgk1-rs7-201ENSMUST00000085735 1255 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm36211-201ENSMUST00000198171 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Nxpe1-ps-201ENSMUST00000209981 1454 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Bgn-207ENSMUST00000169489 1574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm12397-201ENSMUST00000117674 615 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Pex13-ps-201ENSMUST00000118184 1157 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Olfr1060-ps1-201ENSMUST00000118335 943 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm14145-201ENSMUST00000133385 508 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Aif1l-207ENSMUST00000148056 670 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm14146-201ENSMUST00000155885 508 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Gast-201ENSMUST00000017309 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm22662-201ENSMUST00000175290 256 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm26716-201ENSMUST00000181227 415 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm18256-201ENSMUST00000209087 907 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Hax1-201ENSMUST00000079724 1139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Fcrl1-206ENSMUST00000194786 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Gas7-202ENSMUST00000108680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Amd-ps3-201ENSMUST00000072796 1496 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Gm45663-201ENSMUST00000210429 1632 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Dph5-202ENSMUST00000106505 1836 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Use1-203ENSMUST00000110054 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Gm14633-201ENSMUST00000121152 470 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Gm13688-201ENSMUST00000121557 608 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Gm14370-201ENSMUST00000122460 868 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Gm15273-201ENSMUST00000142302 868 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Gm7023-201ENSMUST00000147295 868 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Gm15658-201ENSMUST00000148293 574 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Gm20694-201ENSMUST00000176943 404 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Gm3115-202ENSMUST00000177660 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Gm6337-203ENSMUST00000177662 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Gm3727-202ENSMUST00000178251 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Gm14357-201ENSMUST00000178352 868 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Gm14361-201ENSMUST00000178547 868 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Gm14348-201ENSMUST00000179183 868 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Gm44917-201ENSMUST00000208798 520 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Olfr1394-201ENSMUST00000052668 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Gm8618-201ENSMUST00000097570 432 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms