Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 A630052C17Rik-201ENSMUST00000129876 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Fam161a-201ENSMUST00000058269 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Fam71e2-202ENSMUST00000174409 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Chd1-201ENSMUST00000024620 3196 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Ncam1-201ENSMUST00000114476 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Tia1-201ENSMUST00000095752 3130 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Gm42450-201ENSMUST00000199286 2644 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 AU041133-202ENSMUST00000201286 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms