Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Atg2aQ6P4T0 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg2aQ6P4T0 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg2aQ6P4T0 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg2aQ6P4T0 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg2aQ6P4T0 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg2aQ6P4T0 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg2aQ6P4T0 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg2aQ6P4T0 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg2aQ6P4T0 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg2aQ6P4T0 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg2aQ6P4T0 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg2aQ6P4T0 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg2aQ6P4T0 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg2aQ6P4T0 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg2aQ6P4T0 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg2aQ6P4T0 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg2aQ6P4T0 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg2aQ6P4T0 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg2aQ6P4T0 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg2aQ6P4T0 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg2aQ6P4T0 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg2aQ6P4T0 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg2aQ6P4T0 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg2aQ6P4T0 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg2aQ6P4T0 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg2aQ6P4T0 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg2aQ6P4T0 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg2aQ6P4T0 Gm6794-201ENSMUST00000203829 457 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg2aQ6P4T0 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg2aQ6P4T0 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg2aQ6P4T0 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg2aQ6P4T0 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg2aQ6P4T0 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg2aQ6P4T0 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg2aQ6P4T0 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg2aQ6P4T0 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atg2aQ6P4T0 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Srd5a3-203ENSMUST00000113507 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg2aQ6P4T0 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms