Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ParpbpQ6IRT3 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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