Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Ighv1-5-201ENSMUST00000103494 294 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm14717-201ENSMUST00000140450 649 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm31138-201ENSMUST00000212296 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm13192-201ENSMUST00000101199 208 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm10443-201ENSMUST00000119024 210 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm20568-201ENSMUST00000197129 208 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Nsmce2-203ENSMUST00000227173 1122 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Olfr1263-201ENSMUST00000111507 1029 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm15976-201ENSMUST00000129701 429 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 C230062I16Rik-203ENSMUST00000208015 648 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Mcpt4-201ENSMUST00000043249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Iah1-201ENSMUST00000076813 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Hmox1-201ENSMUST00000005548 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms