Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Ank3-242ENSMUST00000183261 4999 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Gm9992-201ENSMUST00000070059 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Gm26625-201ENSMUST00000181519 2538 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Amph-201ENSMUST00000003345 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Epn2-204ENSMUST00000108713 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Gabra5-203ENSMUST00000206734 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Prkcd-208ENSMUST00000112211 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Eno2-201ENSMUST00000004378 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Ccdc93-201ENSMUST00000036025 7274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Suclg2-204ENSMUST00000204224 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Smarcc2-202ENSMUST00000099131 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Sema4d-203ENSMUST00000110040 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Xpo7-201ENSMUST00000022696 4472 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Hmgb1-201ENSMUST00000085546 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Lrrc49-204ENSMUST00000114034 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Gm16486-201ENSMUST00000212436 4584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Arhgap17-202ENSMUST00000106442 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Nkx2-2os-201ENSMUST00000136998 4345 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Cass4-201ENSMUST00000099061 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Dlgap2-208ENSMUST00000150247 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Gm19656-201ENSMUST00000208543 4610 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Ldlr-201ENSMUST00000034713 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Thbs3-202ENSMUST00000119084 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Gm17980-201ENSMUST00000217977 2349 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Gm13938-201ENSMUST00000156809 493 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Nfrkb-201ENSMUST00000086167 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Slc34a2-201ENSMUST00000094787 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Fut10-201ENSMUST00000066173 3183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Nipal3-202ENSMUST00000105856 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Tns1-201ENSMUST00000169786 9966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 AI854703-202ENSMUST00000154570 3806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Mre11a-201ENSMUST00000034405 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Ppil2-201ENSMUST00000023455 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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