Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm29644-201ENSMUST00000189003 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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