Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm14538-201ENSMUST00000122019 1327 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm22751-201ENSMUST00000102077 109 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Mir692-3-201ENSMUST00000102079 109 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Mir692-2-201ENSMUST00000102081 109 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Fhl3-202ENSMUST00000106199 1139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm8864-201ENSMUST00000118653 1010 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm11686-201ENSMUST00000122397 333 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm15579-201ENSMUST00000141299 757 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm23916-201ENSMUST00000158484 399 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm20467-201ENSMUST00000172872 994 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Ube2i-214ENSMUST00000174216 1144 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc28a-205ENSMUST00000174592 882 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Rps18-206ENSMUST00000174609 527 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm26698-201ENSMUST00000181290 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm42952-204ENSMUST00000198572 408 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm44196-203ENSMUST00000204359 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm11231-201ENSMUST00000117895 1706 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Zwilch-209ENSMUST00000176299 1831 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm12796-201ENSMUST00000131864 344 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 2010204K13Rik-203ENSMUST00000150671 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Baat-202ENSMUST00000166036 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm26931-201ENSMUST00000182273 609 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 1700063D05Rik-203ENSMUST00000191461 666 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 4933436E23Rik-201ENSMUST00000192824 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm42208-201ENSMUST00000198215 670 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm44159-201ENSMUST00000204065 442 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm2716-201ENSMUST00000212350 643 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 AC151971.6-201ENSMUST00000216193 866 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm8174-201ENSMUST00000064353 1001 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Zfp868-201ENSMUST00000074982 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Vps25-201ENSMUST00000007533 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Olfr1511-201ENSMUST00000078171 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn2bQ0KL01 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm5501-201ENSMUST00000165917 832 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Arpp19-207ENSMUST00000169188 216 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms