Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms