Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Gm9575-201ENSMUST00000122140 1339 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Gm15161-201ENSMUST00000117340 387 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp46P62069 4931428L18Rik-201ENSMUST00000127775 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp46P62069 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Ss18l2-205ENSMUST00000215833 479 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp46P62069 RMST_1.1-204ENSMUST00000217871 699 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp46P62069 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Olfr1180-201ENSMUST00000099824 1063 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Usp46P62069 Gm5082-203ENSMUST00000221920 1518 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Usp46P62069 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Usp46P62069 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Usp46P62069 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp46P62069 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
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Usp46P62069 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Gm19253-201ENSMUST00000204279 307 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Gm30709-202ENSMUST00000222476 956 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Elobl-201ENSMUST00000061938 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp46P62069 B230118H07Rik-201ENSMUST00000090513 969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Trappc3l-201ENSMUST00000095758 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp46P62069 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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