Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Copz1P61924 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Copz1P61924 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Copz1P61924 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Copz1P61924 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Copz1P61924 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Copz1P61924 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Copz1P61924 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Copz1P61924 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Copz1P61924 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Copz1P61924 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Copz1P61924 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Copz1P61924 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Copz1P61924 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms