Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Cxcr1-201ENSMUST00000053389 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Gm8725-201ENSMUST00000221829 1333 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Saxo2-205ENSMUST00000207693 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Gm14630-201ENSMUST00000118057 246 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Gm14639-201ENSMUST00000120850 866 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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Lbx1P52955 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Epp13-201ENSMUST00000121024 957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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