Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Itpa-ps1-201ENSMUST00000117207 597 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Gm12470-201ENSMUST00000117239 1049 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Gm12736-201ENSMUST00000119330 236 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Rplp0-ps1-201ENSMUST00000122125 933 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Gm15976-201ENSMUST00000129701 429 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Tpi1-203ENSMUST00000149610 802 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Gm4868-201ENSMUST00000164138 789 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Gm5808-201ENSMUST00000178090 357 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 AC154213.1-201ENSMUST00000228234 583 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Gzmk-201ENSMUST00000038212 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Mcpt4-201ENSMUST00000043249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Gm16209-201ENSMUST00000118457 627 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 4930533B01Rik-201ENSMUST00000123377 1029 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Gm829-201ENSMUST00000123741 465 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Cryzl1-206ENSMUST00000124282 1187 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Junos-202ENSMUST00000125438 559 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Gm10171-201ENSMUST00000126220 628 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Gm7805-201ENSMUST00000154348 448 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Gm25394-201ENSMUST00000157338 133 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 2410124H12Rik-201ENSMUST00000160494 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Gm4705-201ENSMUST00000177415 354 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 1110020A21Rik-201ENSMUST00000181147 853 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 AC118639.1-202ENSMUST00000226957 653 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Gm10233-201ENSMUST00000089275 628 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Gm9507-201ENSMUST00000095491 877 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Kcne3-202ENSMUST00000170954 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 AC154354.1-203ENSMUST00000225565 1364 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd10P28359 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
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