Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P18533 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18533 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18533 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P18533 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18533 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18533 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18533 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18533 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18533 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18533 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18533 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18533 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18533 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P18533 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18533 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18533 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18533 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P18533 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18533 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18533 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18533 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18533 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18533 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18533 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18533 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
P18533 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18533 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18533 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18533 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18533 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18533 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18533 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
P18533 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18533 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
P18533 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
P18533 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
P18533 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
P18533 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
P18533 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
P18533 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18533 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
P18533 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
P18533 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
P18533 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18533 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18533 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18533 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
P18533 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18533 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18533 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18533 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
P18533 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
P18533 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18533 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
P18533 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18533 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18533 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18533 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18533 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18533 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18533 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18533 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18533 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18533 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18533 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18533 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18533 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18533 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
P18533 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18533 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18533 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18533 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18533 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18533 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18533 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18533 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18533 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18533 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18533 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18533 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18533 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18533 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18533 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18533 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18533 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18533 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18533 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18533 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
P18533 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18533 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
P18533 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
P18533 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18533 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18533 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
P18533 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18533 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18533 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18533 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
P18533 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
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