Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Rgs8-202ENSMUST00000111810 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Sorcs1-208ENSMUST00000211687 7080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Pex7-201ENSMUST00000020182 8099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Astn1-201ENSMUST00000046110 7195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Phf20-201ENSMUST00000037401 5737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Anln-201ENSMUST00000040912 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Igf2bp1-201ENSMUST00000013559 8378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 AC154352.1-201ENSMUST00000221477 2365 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Carmil1-202ENSMUST00000110398 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms