Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Gm13938-201ENSMUST00000156809 493 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Gm15666-202ENSMUST00000219490 2796 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Nuggc-201ENSMUST00000079469 2567 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Gpr63-201ENSMUST00000038920 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Git2-203ENSMUST00000112183 4886 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 AC153370.2-201ENSMUST00000217920 3093 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Ahrr-202ENSMUST00000109640 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Pde1c-204ENSMUST00000164752 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Gm21969-201ENSMUST00000178644 4402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Zmiz2-204ENSMUST00000109786 4319 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Gm32552-201ENSMUST00000217849 2291 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Bcorl1-203ENSMUST00000136348 7446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Gm43135-201ENSMUST00000196442 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Ap1g1-206ENSMUST00000179104 1096 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Vmn2r-ps97-201ENSMUST00000222427 1970 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Nkx2-2os-201ENSMUST00000136998 4345 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Nrep-201ENSMUST00000051087 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 N4bp2l1-205ENSMUST00000202031 1864 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Gfm2-208ENSMUST00000161639 3157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Pgbd5-206ENSMUST00000172566 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Rsrc1-201ENSMUST00000046542 3062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Rnf43-202ENSMUST00000092800 4037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Ctnnd1-223ENSMUST00000111697 5294 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Sbf2-205ENSMUST00000164759 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Dnm3-201ENSMUST00000070330 4601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Gm27177-201ENSMUST00000183339 2946 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Ctc1-201ENSMUST00000021278 4164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Nlrx1-201ENSMUST00000034621 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Fam122b-201ENSMUST00000071023 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ptpn20O55082 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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