Protein–RNA interactions for Protein: E9QLQ1

Defa35, Defensin, alpha, 35, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa35E9QLQ1 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
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Defa35E9QLQ1 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
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Defa35E9QLQ1 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
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Defa35E9QLQ1 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
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Defa35E9QLQ1 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
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Defa35E9QLQ1 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Defa35E9QLQ1 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Defa35E9QLQ1 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
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Defa35E9QLQ1 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
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Defa35E9QLQ1 Nkx2-2os-201ENSMUST00000136998 4345 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Defa35E9QLQ1 Tbcel-203ENSMUST00000125995 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Defa35E9QLQ1 D030028A08Rik-202ENSMUST00000131501 3542 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Defa35E9QLQ1 Epn2-203ENSMUST00000108712 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Defa35E9QLQ1 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Defa35E9QLQ1 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Defa35E9QLQ1 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Defa35E9QLQ1 Nfkbiz-204ENSMUST00000114458 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Defa35E9QLQ1 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Defa35E9QLQ1 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Defa35E9QLQ1 Tsix-202ENSMUST00000211291 3263 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Defa35E9QLQ1 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Defa35E9QLQ1 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Defa35E9QLQ1 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Defa35E9QLQ1 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Defa35E9QLQ1 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Defa35E9QLQ1 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms