Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2C0

Cfap46, Cilia and flagella-associated protein 46, mousemouse

Predictions only

Length 2,641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap46E9Q2C0 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Gm19228-201ENSMUST00000214030 717 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Pebp1-201ENSMUST00000036951 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 St3gal6-207ENSMUST00000137035 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 4930509H03Rik-201ENSMUST00000196088 1215 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Fkbp6-202ENSMUST00000201534 1287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Fxyd7-202ENSMUST00000206341 620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Hesx1-202ENSMUST00000224331 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 CT025618.1-201ENSMUST00000227409 1279 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Fxyd7-201ENSMUST00000073892 693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 2700038G22Rik-201ENSMUST00000181574 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Tulp2-203ENSMUST00000107758 1597 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Gm13505-201ENSMUST00000121666 817 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Prss1-201ENSMUST00000031910 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Ttc39b-203ENSMUST00000102823 8831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Zzef1-201ENSMUST00000069395 11150 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Capns1-202ENSMUST00000108196 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Rian-208ENSMUST00000182370 352 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Gm13426-201ENSMUST00000117887 795 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Gm13031-201ENSMUST00000140501 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Gm20483-201ENSMUST00000173162 851 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Gm6518-201ENSMUST00000208450 342 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cfap46E9Q2C0 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms