Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Msrb1-202ENSMUST00000115262 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Gm11540-201ENSMUST00000117457 780 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Gm8482-201ENSMUST00000117972 471 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Gm13841-201ENSMUST00000118829 483 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Gm11449-201ENSMUST00000119175 476 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Gm13688-201ENSMUST00000121557 608 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Gm8210-201ENSMUST00000178557 483 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Gm15454-201ENSMUST00000179718 483 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Ighv1-86-201ENSMUST00000200562 353 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Gm44196-203ENSMUST00000204359 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Gm6344-201ENSMUST00000075962 483 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Prl8a1-202ENSMUST00000095926 1682 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Ccdc42-202ENSMUST00000102612 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Il15ra-203ENSMUST00000114831 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Gm12435-201ENSMUST00000118949 1016 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Pradc1-204ENSMUST00000126805 953 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Gm26875-201ENSMUST00000181006 950 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 BC025446-202ENSMUST00000185307 758 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Gm29200-201ENSMUST00000188118 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Gm36307-201ENSMUST00000195831 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Rhoc-205ENSMUST00000196817 877 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Gm18122-201ENSMUST00000211390 904 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Ppid-201ENSMUST00000029382 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Myo5cE9Q1F5 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Gm14650-201ENSMUST00000120400 889 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Gm12853-201ENSMUST00000134971 442 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Gm13031-201ENSMUST00000140501 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Gm13393-201ENSMUST00000141935 396 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Gm20703-201ENSMUST00000175668 385 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Rab26-204ENSMUST00000176533 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Gm25591-201ENSMUST00000177317 94 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Gm17733-201ENSMUST00000181883 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Gsdmcl2-202ENSMUST00000185391 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Gm34248-201ENSMUST00000200027 474 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Gm42803-201ENSMUST00000201051 451 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Gm18256-201ENSMUST00000209087 907 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 AC139155.1-201ENSMUST00000226043 444 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 2010109A12Rik-201ENSMUST00000031330 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Mcemp1-201ENSMUST00000014118 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 A930003A15Rik-201ENSMUST00000100083 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Rps6-201ENSMUST00000102814 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Stmn3-201ENSMUST00000103045 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Stamos-201ENSMUST00000152524 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Gm7805-201ENSMUST00000154348 448 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Gm42493-201ENSMUST00000197559 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Eif3k-204ENSMUST00000208616 909 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Sult2b1-207ENSMUST00000210754 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Klk1b22-201ENSMUST00000077528 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Fhl1-202ENSMUST00000114768 1337 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Myo5cE9Q1F5 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms