Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Ccdc97Q9DBT3 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Slc22a13-201ENSMUST00000084797 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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Ccdc97Q9DBT3 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Ccdc97Q9DBT3 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Ccdc97Q9DBT3 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 P3h1-202ENSMUST00000081606 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Ccdc97Q9DBT3 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Ccdc97Q9DBT3 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Ccdc97Q9DBT3 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Ccdc97Q9DBT3 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Ccdc97Q9DBT3 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Ccdc97Q9DBT3 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Ccdc97Q9DBT3 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Ccdc97Q9DBT3 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Ccdc97Q9DBT3 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Itgad-202ENSMUST00000106237 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Defa-ps4-201ENSMUST00000118021 183 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
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