Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Commd4Q9CQ02 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Commd4Q9CQ02 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Commd4Q9CQ02 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Commd4Q9CQ02 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Commd4Q9CQ02 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Commd4Q9CQ02 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Commd4Q9CQ02 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Commd4Q9CQ02 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Commd4Q9CQ02 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Commd4Q9CQ02 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Commd4Q9CQ02 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Commd4Q9CQ02 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Commd4Q9CQ02 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Commd4Q9CQ02 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Commd4Q9CQ02 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Commd4Q9CQ02 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm20715-201ENSMUST00000054781 4460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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