Protein–RNA interactions for Protein: Q99KI3

Emc3, ER membrane protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emc3Q99KI3 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Emc3Q99KI3 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Emc3Q99KI3 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Emc3Q99KI3 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Emc3Q99KI3 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Emc3Q99KI3 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Emc3Q99KI3 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Emc3Q99KI3 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Emc3Q99KI3 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Emc3Q99KI3 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Emc3Q99KI3 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Emc3Q99KI3 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Emc3Q99KI3 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Emc3Q99KI3 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Emc3Q99KI3 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Emc3Q99KI3 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Emc3Q99KI3 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Emc3Q99KI3 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Emc3Q99KI3 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Emc3Q99KI3 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Emc3Q99KI3 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Emc3Q99KI3 Nfya-202ENSMUST00000078800 3653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Emc3Q99KI3 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Emc3Q99KI3 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Emc3Q99KI3 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Emc3Q99KI3 Epb41-202ENSMUST00000054917 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Emc3Q99KI3 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Emc3Q99KI3 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Emc3Q99KI3 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Emc3Q99KI3 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Emc3Q99KI3 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Emc3Q99KI3 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Emc3Q99KI3 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Emc3Q99KI3 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Emc3Q99KI3 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Emc3Q99KI3 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Emc3Q99KI3 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Emc3Q99KI3 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Emc3Q99KI3 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Emc3Q99KI3 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Emc3Q99KI3 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Emc3Q99KI3 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Emc3Q99KI3 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Emc3Q99KI3 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Emc3Q99KI3 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Emc3Q99KI3 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Emc3Q99KI3 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Emc3Q99KI3 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Emc3Q99KI3 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Emc3Q99KI3 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Emc3Q99KI3 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Emc3Q99KI3 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Emc3Q99KI3 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Emc3Q99KI3 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Emc3Q99KI3 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Emc3Q99KI3 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Emc3Q99KI3 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Emc3Q99KI3 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Emc3Q99KI3 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Emc3Q99KI3 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Emc3Q99KI3 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Emc3Q99KI3 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Emc3Q99KI3 Gal3st2-201ENSMUST00000094663 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Emc3Q99KI3 Olfr764-ps1-201ENSMUST00000204763 2854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Emc3Q99KI3 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Emc3Q99KI3 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Emc3Q99KI3 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Emc3Q99KI3 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Emc3Q99KI3 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Emc3Q99KI3 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Emc3Q99KI3 Rassf9-202ENSMUST00000219445 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Emc3Q99KI3 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Emc3Q99KI3 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Emc3Q99KI3 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Emc3Q99KI3 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Emc3Q99KI3 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Emc3Q99KI3 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Emc3Q99KI3 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Emc3Q99KI3 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Emc3Q99KI3 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Emc3Q99KI3 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Emc3Q99KI3 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Emc3Q99KI3 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Emc3Q99KI3 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Emc3Q99KI3 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Emc3Q99KI3 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Emc3Q99KI3 Itgad-202ENSMUST00000106237 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Emc3Q99KI3 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Emc3Q99KI3 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Emc3Q99KI3 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Emc3Q99KI3 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Emc3Q99KI3 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Emc3Q99KI3 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Emc3Q99KI3 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Emc3Q99KI3 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Emc3Q99KI3 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Emc3Q99KI3 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Emc3Q99KI3 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Emc3Q99KI3 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Emc3Q99KI3 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.5 ms