Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms